目前，國產儀器在科研、研發和教學用儀器市場占有率偏低，其原因包括以下幾個方面。
一是認知度低。中國農業科學院農業質量標準與檢測技術研究所進行的《農業領域國產分析儀器設備使用與需求現狀調查分析》中顯示，近72％的調查對象認為當前國產儀器整體水平比進口儀器落后10~20年，21％認為落后5年；整體打分方面，49％的被調查者打出7~8分，45％的打出5~6 分，代表使用體驗處于中等。此外，60％的被調查者認為已購置的國產分析儀器可以滿足標準要求，表明大部分被調查者認同國產儀器可以保障正常合規檢測工作，但還有33％的被調查者認為國產儀器只能部分滿足標準要求，其他6％的被調查者則認為不能滿足要求，這也揭示出國產儀器不能完全滿足檢驗檢測機構常規檢測要求的窘境 。
二是用戶體驗不如意。隨著技術發展和競爭加劇，用戶越來越注重產品的使用體驗和售后服務。一方面，國產分析儀器不同程度上均存在以下問題：首先，設備研發者對產品外觀設計認識不足，對儀器的外形觀感不重視。其次，國產設備一直在軟件友好性上偏弱，儀器配套軟件使用復雜且智能度較低，用戶操作不方便，從而降低了產品使用滿意度。第三，國產分析儀器企業售后服務觀念薄弱，出現問題之后的響應速度和服務質量均不盡人意；而進口儀器生產企業則正好相反，不僅講究分析儀器的外觀美感，而且還配有相對充足的專業應用支持人員。
三是創新基礎薄弱。分析儀器的研發是一個周期長、技術難度極高的工作。我國分析儀器研制長期處于跟蹤、模仿狀態，缺少相關理論基礎和制造工藝研究，尤其是高端分析儀器的設計和生產技術儲備不足，缺乏核心技術。分析儀器產業上下游脫節，企業缺乏完整的供應鏈發展環境，導致我國自主研發的分析儀器無論是性能還是穩定性等方面與國外產品相比都存在較大的差距。
另外，我國現行科研評價體系不利于分析儀器研發工作。一方面，由于分析儀器相關的文章影響因子普遍偏低，在以影響因子為主的評價機制下，科研人員缺乏長期研發分析儀器的動力；另一方面，由于國產分析儀器整體性能相較進口分析儀器存在一定的差距，市場認可度不高，通過國產分析儀器得到的數據在投稿行業頂級期刊時，數據質量易受質疑。
四是發達國家技術壁壘。目前，發達國家對我國分析儀器研發設置技術壁壘主要體現在以下方面。標準方面：對我國出口農產品制定嚴格的技術法規標準，而國產技術暫不能滿足要求，需求的不足又反過來制約國產分析儀器的發展；技術方面：限制技術出口，延緩分析儀器研制進程；人才方面：針對外國留學生、訪問學者在接觸美國知識和技術時采取“視同出口”管制政策，造成我國科技人員無法接觸或學習先進技術，從而影響我國分析儀器研發人才培養。
黨的十八大以來，國家把分析儀器國產化和解決卡脖子問題作為科技強國的重要支撐。國家也陸續出臺相關政策，支持國產儀器自主創新。經過分析儀器行業的共同努力，近年來國產分析儀器發展較快，取得長足進步，但是國產分析儀器要想在檢驗檢測行業中逐步實現替代進口，還必須持續深入推進創新。具體建議如下。
一是，消除偏見，改變行政職能機構“唯進口”認識，在分析儀器同等性能技術指標的條件下，加大對國產分析儀器的采購和使用，為國產分析儀器提供更好的應用空間，并重視國產分析儀器應用技術研討和儀器展示，讓技術同行了解國產分析儀器性能指標以及應用的比對結果。同時，通過媒體、網絡、論文等多種形式，加大對國產分析儀器的宣傳力度，樹立國產分析儀器技術可行、質量過硬的正面形象和品牌。
二是，進一步提升國產分析儀器的穩定可靠性和適用性，加大推動分析測試專用儀器的研發與使用。由于低價市場競爭等原因造成企業對產品投入不足、工藝水平和行業基礎差、對高性能產品的技術掌握不夠成熟等問題，使國產分析儀器的穩定可靠性問題尤為突出，使用戶對國產儀器失去了信任，從而制約著國產分析儀器的創新發展。要進一步提升國產分析儀器的穩定可靠性，解決我國儀器儀表行業一大瓶頸問題，才能使國產分析儀器更具有國內外市場競爭力。此外，我國分析測試行業仍然存在機構小、散、弱特征，集約化程度較低，技術人員能力參差不齊等問題。因此，在保證分析儀器合規和穩定可靠的基礎上，要充分考慮分析儀器生產企業分布特點、專業領域、實驗要求和操作習慣存在的差異，從適用性、便捷性、高效性等方面加強研發與改進，研發出系列針對性強、操作便捷、經濟高效的分析測試專用儀器，如測汞儀，并大力推廣應用，滿足我國分析測試行業的發展需要，進一步提升國產分析儀器的美譽度和國內外市場競爭力。
三是，結合我國國情提升自主創新研發能力和應用示范。首先，加強政府引導，增加政策扶持和資本支持，針對目前國產分析儀器產業結構不合理、低端產品重復建設、高端產品研發投入不足等問題，做好國家和地區產業規劃。其次，建立分析儀器綜合驗評指標體系，研制相關技術標準，滿足分析儀器行業國內外產品對標分析、制造企業產品驗證評價和優化改進等各方面的實際需求，推動我國分析儀器行業的產業升級和提質增效。另外，還應通過建立以創新價值、能力、貢獻為導向的科技人才評價體系，轉變評價方式，提高科研機構和科研人員對分析儀器研制的重視程度。
